Причиной появления аномальных прионов РrР^Sс   является не копирование конформации с ранее поврежденного приона, а вызвано блокированием аномальными РrР^Sс прионами ферментных систем (тиоредоксинредуктаза, глутатионредуктаза, пролил-цис-транс-изомераза и дисульфидизомераза)  контролирующих фолдинг полипептидных цепей нормальных РrР^C прионов, а также связано с нарушением функции шаперонов контролирующих фолдинг полипетидных цепей нормальных РrРC прионов и сохранение их нативной структуры:

1. Аномальные прионные белки (РrР^Sс)  нековалентно за счет гидрофобного взаимодействия связываясь с гидрофобными радикалами остатков аминокислот активного центра тиоредоксинредуктазы и глутатионредуктазы, ингибируют эффекты этих ферментов по восстанавливлению дисульфидных связей в белках, и тем самым останавливают  формирование  у различных белков и прежде всего у нормальных клеточных прионов РrР^C правильной третичной структуры.
2. Прионные белки типа РrР^Sс аналогичным механизмом ингибируют дисульфидизомеразу белков, разрезающей S--S-связи, что не дает секретируемым белкам, в том числе и нормальным прионам, после их переноса через мембраны эукариотических клеток достигнуть нужной конформации и тем самым способствуют спонтанному формированию у нормальных клеточных прионов РrР^C  третичной структуры, характерной для аномальных прионов РrР^Sс.
3. Прионные  белки  типа  РrР^Sс   ингибируют  пролилцис-транс-изомеразу, контролирующей цис-трансизомеризацию остатков пролина в полипептидных цепях, что нарушает лимитирующую стадию процесса образования правильной третичной структуры полипептидных цепей любых белков и в том числе  нормальных клеточных прионов РrР^C.
4. Аномальный прионный белок РrР^Sс  попадая в клетки,связывается с центральной гидрофобной полостью шаперона и вызывает  блокирование его функций «расплетание укладку» нефолдированных белков, том числе и нормальных прионов.  В результате этого укладка полипептидной цепи нормальных прионов РrР^C  идет  по типу β-структуры, что и приводит к трансформации их в аномальные прионы РrР^Sс .
5. В результате суммарных изменений активности ферментов фолдинга и функции шаперонов нормальные не фолдированние клеточные прионы превращаясь в РrР^Sс  доставляются к клеточной мембране,  где образуют белковые агрегаты, приводящие к  нарушению функции и к гибели клеток.

Согласно положениям высказанной гипотезы, восстановление и стабилизация активности ферментов фолдинга и функции шаперонов может решить проблему конформационных болезней и может лечь в основу создания лекарств от неизлечимых  на сегодняшний день заболеваний.